解决方案：

set hive.msck.repair.batch.size=1;
set hive.msck.path.validation=ignore;
MSCK REPAIR TABLE table_name;

如果不能设置值，会报错。

在hive-site中添加内容：

key:
hive.security.authorization.sqlstd.confwhitelist.append
value:
hive\.msck\.path\.validation|hive\.msck\.repair\.batch\.size