在 ThinkPHP 6 中，你可以使用 db() 函数来构建复杂的 SQL 查询，以实现 JOIN 并使用 REPLACE 函数。可以按照以下方式修改你的代码：

$res->leftJoin('work', 'work.workID = REPLACE(entry_in.workID, "JP", "")')->where('work.customer_id', $customer_id);

在这个例子中，我们将 REPLACE 函数应用在 JOIN 条件中，将 entry_in.workID 中的 "JP" 替换为空字符串，以便与 work.workID 进行比较。

请注意，这里的关键是确保 entry_in.workID 和 work.workID 的数据类型相同，以确保比较的准确性。

另外，如果你需要在 JOIN 条件中使用更复杂的逻辑，可以考虑使用 Expression 类来构建原始的 SQL 表达式，如下所示：

use think\db\Expression;

$res->leftJoin('work', new Expression('work.workID = REPLACE(entry_in.workID, "JP", "")'))->where('work.customer_id', $customer_id);

使用 Expression 类可以允许你编写更复杂的 SQL 表达式，以满足你的需求。