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生信软件39 - GATK最佳实践流程重构,提高17倍分析速度的LUSH流程

RockYoungTalk 2024-11-03 阅读 2
数据结构

快速排序(quick sort)

一、思路

快速排序是C.R.A.Hoare于1962年提出的一种划分交换排序。它采用了一种分治的策略,通常称其为分治法(Divide-and-ConquerMethod)。

该方法的基本思想是:

  • 1.先从数列中取出一个数作为基准数。
  • 2.分区过程,将比这个数大的数全放到它的右边,小于或等于它的数全放到它的左边。
  • 3.再对左右区间重复第二步,直到各区间只有一个数。

二、例子

步骤:

1.定义待排序数组当中的第一个值作为基准数(base)

2.定义 j 游标,从后往前移动找到第一个比基准数的值停下

3. 定义i 游标,从前往后移动找到第一个比基准数的值停下。

4. i和j数值交换

5. 重复2-4直到 i和j 相遇

6. 基准数和相遇位置的数据进行交换,交换完成之后基准数到达正确位置。

7. 以基准数为起始点,分成左右两部分,重复上述所有,直到数据都被拆分开停止。


三、时间复杂度

第一轮: 1个数组   2^0   1个数据到达正确位置

第二轮: 2个数组  2^1    2个数据到达正确位置

第三轮:4 个数组  2^2   4个数据到达正确位置

...

第k轮:  2^(k-1)个数组    2^(k-1)个数据到达正确的位置

x=1+2+4+...+2^(k-1)

x=2^k-1

k=log2x

O(nlogn)


四、代码

代码

package com.lojarro.排序;

import java.util.Arrays;

public class QuickSort {
public static void main(String[] args) {
int[] arr= {5,7,4,2,0,3,1,6};
sort(arr,0,arr.length-1);
System.out.println(Arrays.toString(arr));
}
public static void sort(int[] arr,int left,int right) {
if(left>=right) {
return;
}
//定义变量保存基准数
int base=arr[left];
//定义i游标j游标
int i=left;
int j=right;

while(i!=j) {
//j游标从后往前移动,找比基准数小的
while(arr[j]>=base&& i<j) {
j--;
}
while(arr[i]<=base&&i<j) {
i++;
}
//i和j进行交换
int temp=arr[i];
arr[i]=arr[j];
arr[j]=temp;

}
//i和j相遇 基准数和相遇位置进行交换
arr[left]=arr[i];
arr[i]=base;

//排序左边
sort(arr,left,i-1);
//排序右边
sort(arr,i+1,right);
}
}

内存图

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