vcftools如何在Linux系统中安装

这里，记录一下vcftools的安装教程。

1. 下载

​​https://vcftools.github.io/examples.html​​

下载到本地，上传到服务器中。

2. 解压缩

 unzip vcftools-vcftools-v0.1.16-18-g581c231.zip
 cd vcftools-vcftools-581c231/

3. 安装

 bash autogen.sh
./configure
 make
make install

安装完成日志：

 /usr/bin/mkdir -p '/usr/local/share/perl5'
 /usr/bin/install -c -m 644 FaSlice.pm Vcf.pm VcfStats.pm '/usr/local/share/perl5'
make[3]: 离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231/src/perl”
make[2]: 离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231/src/perl”
make[2]: 进入目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231/src”
make[3]: 进入目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231/src”
make[3]: 对“install-exec-am”无需做任何事。
make[3]: 对“install-data-am”无需做任何事。
make[3]: 离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231/src”
make[2]: 离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231/src”
make[1]: 离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231/src”
make[1]: 进入目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231”
make[2]: 进入目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231”
make[2]: 对“install-exec-am”无需做任何事。
make[2]: 对“install-data-am”无需做任何事。
make[2]: 离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231”
make[1]: 离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231”

4. 测试

键入vcftools

(base) [root@localhost vcftools-vcftools-581c231]# vcftools

VCFtools (0.1.17)
© Adam Auton and Anthony Marcketta 2009

Process Variant Call Format files

For a list of options, please go to:
  https://vcftools.github.io/man_latest.html

Alternatively, a man page is available, type:
  man vcftools

Questions, comments, and suggestions should be emailed to:
  vcftools-help@lists.sourceforge.net

出现帮助文档，搞定！