以生物信息学工具blast为例,我的安装路径是/home/2023_lcl/biotool/ncbi-blast-2.16.0+/bin
方法1:临时添加到当前会话的PATH 环境变量
你可以使用以下命令将该路径添加到当前终端会话的 PATH 中。这种方法只对当前终端有效,关闭终端后配置会失效:
export PATH=$PATH:/home/2023_lcl/biotool/ncbi-blast-2.16.0+/bin
你可以通过以下命令确认是否已经成功添加:
echo $PATH
然后尝试运行 blastn 来验证是否正确配置:
blastn -version
方法 2:永久添加到 PATH 环境变量
要永久添加 BLAST 的路径到 PATH 中,你可以将路径添加到用户的 .bashrc 文件中,这样每次启动新终端时都会自动加载。
- 使用文本编辑器打开
.bashrc文件:nano ~/.bashrc - 在文件末尾添加以下行,将 BLAST 的安装路径添加到
PATH:export PATH=$PATH:/home/2023_lcl/biotool/ncbi-blast-2.16.0+/bin - 保存并退出编辑器(在 nano 中按
Ctrl + X,然后按Y确认保存)。 - 重新加载
.bashrc文件,或者关闭并重新打开终端:source ~/.bashrc - 验证
PATH是否已更新:echo $PATH - 再次尝试运行
blastn来确认安装成功:blastn -version方法 3:为所有用户设置环境变量
如果你想将 BLAST 的路径添加为系统中所有用户可用的路径,可以将路径添加到系统的 /etc/profile 文件中。不过,这通常需要 sudo 权限。
- 使用管理员权限编辑
/etc/profile:sudo nano /etc/profile - 在文件末尾添加以下行:
export PATH=$PATH:/home/2023_lcl/biotool/ncbi-blast-2.16.0+/bin - 保存并退出,然后重新加载配置文件或重启系统。
总结
- 临时修改环境变量可以使用
export PATH=...,仅对当前会话有效。 - 永久添加到
PATH可以通过编辑.bashrc文件,使 BLAST 在每次启动终端时都能自动加载。 - 验证安装是否成功可以通过运行
blastn -version确认。










