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【荐藏】代谢组学分析系列

浮游图灵 2022-04-27 阅读 64

发现了宝藏知识宝藏博主,他梳理了代谢组学从实验到分析的全流程知识并汇聚成册。大家共同学习呀。

wechat:代谢组学分享平台。为代谢组学入门者提供信息;经验分享;文献共享;资源共享。感谢此君!

代谢组学

  • 代谢组学其实不神秘 
  • 代谢组学的学习过程

代谢组学分类:

  • 非靶向代谢组学丨上
  • 非靶向代谢组学丨中
  • 非靶向代谢组学丨下
  • 靶向代谢组学丨上
  • 靶向代谢组学丨下
  • 拟靶向代谢组学

样本前处理:

  • 图丨血液样本前处理
  • 图丨关于尿液和组织样本前处理
  • 资料分享丨代谢组学样本前处理方法

数据采集:

  • 常见的质谱扫描模式丨Full scan
  • 常见的质谱扫描模式丨DDA & DIA
  • 常见的质谱扫描模式丨SWATH
  • 代谢组学实验中如何选择扫描模式?

数据预处理:

  • 资料分享丨Progenesisi QI 培训材料
  • MS-DIAL丨一款好用的代谢组学数据处理软件
  • MZmine 2丨又一款好用的代谢组学数据处理软件
  • MZmine 2丨Waters raw data 导入
  • MZmine 2丨导出可供MetaboAnalyst分析的数据文件

统计分析:

  • Simca软件的基本操作
  • MetaboAnalyst丨一款免费的代谢组学分析软件
  • HemI丨一款好用的热图绘制软件
  • 代谢组学文章中常见的统计图(一)
  • 代谢组学文章中常见的统计图(二)

标记物筛选:

  • 关于标记物的筛选
  • 代谢组学活性筛选用于发现调节表型的小分子代谢物

标记物鉴定:

  • 关于化合物鉴定
  • 关于化合物的鉴定(续)
  • 关于小分子化合物的鉴定丨选择目标离子
  • 关于小分子化合物的鉴定丨确定元素组成
  • 关于小分子化合物的鉴定丨碎片离子的获得
  • 代谢组学研究中常用的数据库
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